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    Biología celular y Biotecnología

    Biología computacional y Bioinformática

    Dra Ana M. Rojas
    Investigador/a Principal

    Resumen
    Publicaciones relevantes (seleccionadas)
    Miembros del laboratorio y Colaboradores

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    Resumen

    Línea principal de investigación
    La línea principal de investigación del grupo se centra en evolución de proteínas con especial énfasis en la relación estructura/función, todo en el contexto de redes de señalización celular.  Nuestras últimas aportaciones se centran en el uso y desarrollo de modelos de lenguaje de proteínas para la anotación de función donde hemos demostrado las capacidades de anotación en organismos modelo (Barrios-Núñez, et al, 2024, https://doi.org/10.1093/nargab/lqae078),  y en 24 millones de genes de animales basales (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582465v1). hemos creado una herramienta, FANTASIA (https://github.com/CBBIO/FANTASIA) que permite anotar millones de genes usando diferentes modelos de lenguaje.  Otras contribuciones relevantes son el abordaje y evolución de GO a lo largo del tiempo (Valverde et al, 2025, https://doi.org/10.1093/molbev/msaf148), y la identificación de potencial alosterismo en receptores nucleares (https://doi.org/10.1093/nar/gkac1119, https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ade2175).
    Otras líneas de investigación
    Otras líneas de investigación del grupo incluyen la integración de datos transcriptómicos, genómicos y epigenéticos para abordar preguntas biológicas relevantes. Para ello hemos diseñado herramientas bioinformáticas (Andres-Leon, 2016, sci Rep. [PMID:27167008]) que han sido usadas para la identificación de pares mRNA'miRNAs en largas muestras de tumores que pudieran ser potencialmente relevantes para predecir la supervivencia (Figura derecha, [Andres-Leon et al, 2017, Sci Rep. [PMID: 28387377]).
    Si te interesara unirte al grupo de Ana Rojas,  (http//www.bioinfocb.es) por favor contacta con Ana: a.rojas.msrhrb@jsjjdcsic.es o arojmensrhrb@jsjjdupo.es.

    También en esta web:

    CABD - Centro Andaluz de Biología del Desarrollo

    Universidad Pablo de Olavide
    Carretera de Utrera km1
    41013 Sevilla, España
    +34 954977911