PLATAFORMA DE PROTEÓMICA Y BIOQUÍMICA DOROTHY HODGKIN

Vínculos rápidos:
1. DEFINICIÓN DEL SERVICIO
2. SERVICIOS OFRECIDOS
3. PERSONAL Y CONTACTO
4. EQUIPAMIENTO
5. TARIFAS
6. PUBLICACIONES Y RECURSOS WEB

1. DEFINICIÓN DEL SERVICIO


La Plataforma de Proteómica y Bioquímica Dorothy Hodgkin realiza diversos trabajos y estudios con proteínas desde una perspectiva multidisciplinar. Los servicios ofrecidos abarcan desde el análisis de proteomas hasta la purificación de proteínas a la carta, pasando por la caracterización de interacciones intermoleculares o la detección y cuantificación de proteínas en muestras biológicas.
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2. SERVICIOS OFRECIDOS

  • Análisis de muestras por electroforesis SDS-PAGE (1 o 2 dimensiones)
  • Ensayos de Western Blotting (detección y cuantificación de proteínas)
  • Ensayos y análisis de electroforesis en gel diferencial (DIGE)
  • Purificación de proteínas recombinantes a la carta
  • Puesta a punto de producción de proteínas
  • Estudio de interacciones moleculares (SPR o ITC)
  • Caracterización de actividades enzimáticas
  • Asistencia técnica en el diseño y realización de experimentos con proteínas
  • Cuantificación de proteínas
  • Análisis de proteomas (con o sin enriquecimiento)
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3. PERSONAL Y CONTACTO

Responsable de la plataforma:

            Dra Laura Tomás Gallardo - 954978208

Técnicos asociados:

            Ninguno.

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4. EQUIPAMIENTO

•    Sistema de imagen ChemiDoc MP
•    Espectrofotómetro UV-Vis Shimadzu UV-1280
•    Escáner Image scanner III (Cytiva)
•    Escáner Láser Amersham Typhoon RGB (Cytiva)
•    Sistemas de electroforesis
•    IPGPhor (Cytiva)
•    Sonicador Branson SFX 550
•    Biacore X100 (Cytiva)
•    Nanocalorímetro PEAQ-ITC (MicroCal - Malvern)
•    Cabina de flujo laminar Cruma HZ-2
•    Microcentrífuga 5415R (Eppendorf)
•    Incubado Innova 42 (New Brunswick- Eppendorf)
•    Sistema de transferencia Trans-Blot Turbo (BioRad)
•    ÄKTA™ Pure 25 FPLC (Cytiva)
•    Liofilizador Telstar LyoQuest -85

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5. TARIFAS

 
Servicios ofertados
TARIFA
CABD Universidades y OPIs Empresas/Otros
CONSUMO DE REACTIVOS
Electroforesis 1-D Gel pequeño (8 x 7 cm) 11,00 € 16,00 € 22,00 €
Gel mediano (10-18 x 22 cm) 22,00 € 32,00 € 42,00 €

Tinción
    Gel pequeño (8x7 cm)

Azul de Coomassie modificado 5,00 € 6,00 € 7,00 €
Plata 6,00 € 7,00 € 8,00 €
Imidazol 4,00 € 4,50 € 5,00 €
Cuantificación de
proteínas
Densitometría (gel pequeño) 15,00 € 19,00 € 23,00 €
Lowry (Kit RC-DC) 5,00 €/ muestra 7,00 €/ muestra 9,00 €/ muestra
USO DE EQUIPOS 39
FPLC (ÄKTA pure)  11,00 €/ día  16,00 €/ día  22,00 €/ día
SPR (Biacore X-100)  16,00 €/ día  27,00 €/ día  35,00 €/ día
 ITC (Malvern PEAQ-ITC)  16,00 €/ día  27,00 €/ día  35,00 €/ día
TÉCNICAS
Preparación de muestras 40 10,00 € 15,00 € 20,00 €
Purificación de
proteínas
recombinantes en
bacterias 39, 43
Tipo A 320,00 € 395,00 € 470,00 €
Tipo B 620,00 € 770,00 € 920,00 €
Tipo C 770,00 € 1.020,00 € 1.520,00 €
Western Blotting 41
    Gel pequeño (8x7 cm)
25,00 € 35,00 € 45,00 €
Electroforesis 2-D 42 Minigel (8x7 cm) 25,00 € 35,00 € 45,00 €
Midigel (10-18 x 22 cm) 40,00 € 70,00 € 90,00 €
Maxigel (26x22 cm) 60,00 € 110,00 € 130,00 €
DIGE 39, 43, 42 DIGE maxigel 300,00 € 400,00 € 500,00 €
Análisis de imagen (DeCyder) 30,00 €/h. 40,00 €/h. 50,00 €/h.
Ensayos de
Interacción 39, 43
SPR (Biacore X-100) 525,00 € 700,00 € 875,00 €
ITC (Malvern PEAQ-ITC) 100,00 € 150,00 € 300,00 €
DISEÑO EXPERIMENTAL 39, 43
Puesta a punto en producción de proteínas 20,00 €/h. 25,00 €/h. 30,00 €/h.
Asesoramiento técnico 22,00 €/h. 27,00 €/h. 32,00 €/h.
Trabajo de personal técnico 40,00 €/h. 50,00 €/h. 60,00 €/h.

39 Solicitar presupuesto según características del experimento
40 Incluye, lisis, inhibidores de proteasas, limpieza y cuantificación.
41 Incluye electroforesis, transferencia, detección y análisis de imagen. El usuario aportará el anticuerpo.
42 Incluye tinción del gel.
43 Solicitar presupuesto según características del experimento

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6. Publicaciones y Recursos web

Publicaciones:

Recursos web:

  • Transcription and Translation Tool: Converts sequences from DNA to RNA and from this to protein.

           http://biomodel.uah.es/en/lab/cybertory/analysis/trans.htm

  • ProtParam tool: allows the computation of various physical and chemical parameters for a given protein.

            https://web.expasy.org/protparam/

  • SnapGene Viewer: View, annotate and share plasmid sequence files.

            https://www.snapgene.com/snapgene-viewer

  • Expasy: Swiss Bioinformatics Resource Portal

            https://www.expasy.org/

  • Uniprot: Base de datos de secuencias de proteínas e información funcional.

            https://www.uniprot.org/

  • Fold-It: Programa de ciencia ciudadana que permite contribuir a investigaciones científicas mediante una dinámica lúdica de plegamiento de proteínas.

            https://fold.it/

  • AlphaFold: Base de datos de estructuras de proteínas resueltas por IA.

            https://alphafold.ebi.ac.uk/

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