Biología celular y Biotecnología

Biología computacional y Bioinformática

Resumen

Línea principal de investigación
La línea principal de investigación del grupo se centra en evolución de proteínas con especial énfasis en la relación estructura/función, todo en el contexto de redes de señalización celular
Como ejemplos de abordajes, hemos identificado nuevas potenciales funciones y residuos involucrados en la especificidad funcional de la superfamilia de proteínas RAS (Rojas et al, 2012, [PMID:22270915]), descrito la red central de rutas que establecen la respuesta al daño en el ADN en humanos (Arcas et al, Mol Biol Evol, 2014, [PMID: 24441036], y descubierto una nueva ruta de reparación del ADN en procariotas (Figura izquierda, Castañeda et al, 2017, Nat Comm [DOI:10.1038/ncomms14246]).
En estas líneas, hemos colaborado extensivamente con grupos experimentales para delucidar las funciones biológicas de ciertas proteínas. Por ejemplo, describir el papel de EXD2 en la mitocondria (Silva et al,  2018, Nat Cell Biol. [PMID: 29335528]) o analizar en detealle el impacto funcional de mutaciones en proteinas de pacientes (Trsitan-Calvijo et al, 2016, Mov Disords [PMID 27477325]).
 
 
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Otras líneas de investigación
Otras líneas de investigación del grupo incluyen la integración de datos transcriptómicos, genómicos y epigenéticos para abordar preguntas biológicas relevantes. Para ello hemos diseñado herramientas bioinformáticas (Andres-Leon, 2016, sci Rep. [PMID:27167008]) que han sido usadas para la identificación de pares mRNA'miRNAs en largas muestras de tumores que pudieran ser potencialmente relevantes para predecir la supervivencia (Figura derecha, [Andres-Leon et al, 2017, Sci Rep. [PMID: 28387377]).
Si te interesara unirte al grupo de Ana Rojas, (http://www.idoproteins.com), por favor contacta con Ana: a.rojas.mnxnzp@jxzsncsic.es o arojmennxnzp@jxzsnupo.es.