Todos los vertebrados comparten un diseño embrionario común derivado de la actividad funcional de genes homólogos que operan durante el desarrollo embrionario. En los últimos años, la comparación de genomas ha permitido demostrar que, además de las regiones codificantes, las regiones genómicas de los genes encargados de generar patrones morfogenéticos  durante el desarrollo contienen regiones no codificantes altamente conservadas (RNACs).  Estudios funcionales a pequeña escala realizados por distintos grupos, incluyendo el nuestro, indican que un gran porcentaje de RNACs analizadas contienen elementos reguladores responsables de activar la expresión en dominios específicos durante el desarrollo embrionario.

 

En nuestro grupo, estamos iniciando un estudio a escala genómica de la actividad funcional de la colección completa de RNACs (unas 3000) presentes en todos los vertebrados. Para ello, estamos generando líneas transgénicas estables de pez cebra de todas las RNACs con actividad cis-reguladora. Esta colección, de gran valor para la comunidad científica, será una herramienta esencial para descifrar los mecanismos moleculares y las redes génicas que operan durante el desarrollo de vertebrados. Así mismo,  esta colección permitirá comparaciones de patrones de expresión y secuencias, lo que facilitará el desafío futuro de decodificar el lenguaje de los elementos cis-reguladores. Además, estudios funcionales de regiones ortólogas de distintas especies en pez cebra nos ayudará a comprender la evolución. Pretendemos, igualmente, identificar RNACs específicas asociadas con diferentes enfermedades géticas humanas como cáncer, diabetes o sordera. Finalmente, estamos realizando un análisis de la relevancia funcional en el contexto genómico in vivo de algunas de estas RNACs así como de los mecanismos moleculares que operan a través de estas. Para ello, nos estamos centrando en algunas de las RNACs de los complejos Irx identificadas recientemente.