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Grupos de investigación

Biología celular y Biotecnología

Antonio J. Pérez. UPO
Bioinformática para el análisis de secuencias biológicas
Antonio J. Pérez. UPO
Researcher associated to Dr Juan Jiménez Martínez. UPO

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Resumen

Nuestra investigación está enfocada en la bioinformática aplicada a la resolución de problemas biológicos. Ya que la bioinformçtica puede acelerar determinados experimentos de laboratorio, mediante el filtro inicial de la información biológica o mediante el análisis posterior de resultados, tratamos de desarrollar técnicas y algoritmos que tengan una aplicación directa. Por ello, generalmente intentamos publicar las herramientas que desarrollamos para su libre uso por parte de la comunidad científica, bien sea como aplicaciones web o bien como programas ejecutables. Aunque, por otro lado, también colaboramos con otros grupos para realizar análisis determinados de secuencia, estructura o análisis de datos masivos. Como ejemplos de las herramientas desarrolladas por nuestro grupo, están semirna (para la predicción de microRNAs), Sma3s (para la anotación funcional de conjuntos masivos de secuencias) u orthoFinder (para la búsqueda de proteínas ortólogas). Para consultar todas las herramientas que hemos desarrollado, puede visitarse la web de nuestro grupo UPO-Genetics Bioinformatics Group.

Recientemente también estamos centrados en el análisis de secuencias ligadas a enfermedades humanas, habiendo comenzado a obtener resultados en enfermedades raras como la Atrofia Muscular Espinal, en la que estamos interesados en demostrar la homología entre axones neuronales y filamentos fúngicos.